Structure et classification des virus

I -Définition :
Les virus sont des microorganismes qui ne peuvent être examinés qu’en microscopie électronique
Ils ne possèdent qu’un seul type d’acide nucléique ARN ou ADN
Ils ne se multiplient qu’à l’intérieur de la cellule vivante en utilisant leur machinerie cellulaire …c’est un parasitisme obligatoire
II -Structure :
Le virus est constitué :
*Au centre de l’acide nucléique
*En périphérie d’une capside protéique protégeant l’acide nucléique
Acide nucléique + capside = nucléocapside ou care
Et parfois d’une enveloppe qui peut être hérissée de spicules permettant au virus de se fixer aux cellules et d’y pénétrer ou d’en sortir
1/ Le génome viral
Comme tous les génomes ; le génome viral est composé d’acide nucléique qui se trouve au cœur de la particule virale, directement lié aux protéines de la capside nucléocapside
Composé soit d’ARN ou d’ADN
Il y a une grande diversité dans la nature et la structure de ces acides nucléiques :
ARN monocaténaire linéaire
ARN monocaténaire circulaire
ARN bicaténaire
AND monocaténaire linéaire
AND bicaténaire linéaire
AND bicaténaire circulaire
L’ARN peut être de polarité positive + ou négative –
ARN+ : ARN qui peut être traduit par les ribosomes
ARN- : ARN viral qui doit être transcrit en ARNm ( par la transcriptase virale)
2/ La capside
Le capside est une structure protéique qui protége le génome viral
La taille, la forme et complexité de la capside varient d’une famille de virus à une autre
Il existe deux grands types de structure de capside
-Synergie hélicoïdale (fréquente chez les virus des plantes)
-Synergie cubique (forme d’un icosaèdre) : plus fréquente chez les virus qui infectent les cellules animales
Il existe aussi :
Une Structure combinée : tête de synergie cubique et queue de synergie hélicoïdale
Cette structure est observée uniquement chez les bactériophages
Fonction de la capside :
Protége le virus (dans le milieu externe)
Pour les virus nus (sans enveloppe), c’est elle qui porte les déterminants viraux qui se lient spécifiquement à des récepteurs cellulaires
3/ L’enveloppe :
Certains virus sont entourés d’une enveloppe formée d’une bicouche lipidique (dérivée de la membrane de la cellule infectée) dans laquelle sont insérées des protéines codées par le génome viral
Elle est fréquente chez les virus animaux
Elle porte les déterminants viraux qui se lient spécifiquement aux récepteurs cellulaires
L’enveloppe confère une certaine fragilité au virus ; les virus enveloppés sont donc plus fragiles que les virus nus.
III -Classification :
1/ critères de classification
On a d’abord classé les virus :
1.selon l’organisme parasité :
Virus animaux
Virus des plantes
Virus des bactéries
2. selon le mode de transmission
Virus transmis par les voies respiratoires …etc

La classification actuelle est celle proposée par LWOFF en 1961
Elle est basée sur les données morphologiques et biochimiques
Elle repose sur un système très strict encadré par la commission internationale de la taxonomie virale (CITV)
Les critères de classification sont :
1. le génome
a) nature de l’acide nucléique : ADN ou ARN
b) structure de l’acide nucleique : bicatenaire ou monocaténaire
c) forma de l’acide nucléique : linéaire, circulaire, sermenté, non sermenté
d) polarité : positive ou negative
2. l’enveloppe :
Virus nu ou virus enveloppé
3. la symétrie :
Symétrie hélicoïdale (H), symétrie cubique (C) ou symétrie inconnue
2/ Nomenclature :
Elle se refaire à la classification de Linné : RECOFGERVI
Règne, Embranchement, Classe, Ordre, Famille, Genre, espèce, Race, Variété, Individu.
En plus simple : on repartie les virus en familles et sous familles, elles mêmes subdividivisées en genres qui regroupent les espèces
Les familles :
Sont désignées par un préfixe latin ou grec suivie de viridae
Ex : Herpesviridea, Myxoviridae, Picornaviridae (pico = petit, rna= ARN)…..etc
Les genres :
Sont désignés de la même manière, on remplace viridae par virus
Ex : Myxovirus, Adenovirus
Les espèces :
Au genre, on ajoute un nom d’espèce
Ex : Herpesvirus simplex……abréviation : HSV